Система анализа и пространственной визуализации данных по лекарственной устойчивости и молекулярному типированию возбудителей ИППП.

Опубликовано: 5 месяцев, 2 недели назад

    Системы визуализации
  • Одной из важных проблем борьбы с инфекциями, передаваемыми половым путем (ИППП), является распространение лекарственной устойчивости возбудителей. В рамках российской программы по мониторингу антибиотикорезистентности N. gonorrhoeae (RU-GASP) и программы «Система анализа данных и прогнозирования распространения антибиотикорезистентности штаммов T. pallidum на территории Российской Федерации на основе методов молекулярной эпидемиологии», разработанной ГНЦДК, производятся сбор изолятов возбудителей, их молекулярное типирование и анализ лекарственной устойчивости. Эти исследования направлены на разработку технологии оценки и прогноза распространенности антибиотикорезистентных штаммов возбудителей инфекций, передаваемых половым путем (ИППП), выявление факторов, определяющих динамику лекарственной устойчивости возбудителей, и оценку связи между мутациями возбудителя и лекарственной устойчивостью. При решении этих задач применяются современные методы статистического анализа пространственно распределенных величин и ГИС-технологии. Эти методы реализованы в разработанной нами программе STIanafor (STI Analysis & Forecasting), позволяющей сопоставлять данные по лекарственной устойчивости возбудителей с информацией о заболеваемости, данными молекулярного типирования и результатами филогенетического анализа геномов возбудителей. Программа позволяет строить карты географического распределения заболеваемости, лекарственной устойчивости, рассчитывать индексы резистентности, анализировать распространенность мутантных возбудителей по регионам, представлять возможные варианты миграционного переноса возбудителя. Она также позволяет прогнозировать развитие лекарственной резистентности и заболеваемости по данным и экспертным оценкам.

    Авторы: Каркач А. С. [2] Романюха. А. А. [2] Соломка В. С. [1] Фриго Н. В. [1] Чупров-Неточин Р. Н. [1] Волков И. А. [1] Суворова. А. А. [1]

    Темы: анализ1 биоинформационная система1 гис3 иппп1 лекарственная устойчивость1 прогноз5

Статей
11

Авторов
34

Страниц
80

Последние номера

Архив журнала >
2017

«Мз» №3 2017

Дата выпуска: 2017-10-03

569

«Мз» №2 2017

Дата выпуска: 2017-02-22

1044

«Мз» №1 2017

Дата выпуска: 2017-01-15

653

2016

«Мз» №6 2016

Дата выпуска: 2016-06-06

483